Holl Imre érdeklődése a kézművesek és termékeik, illetve a középkori városok anyagi kultúrája iránt végigkísérte pályáját.

Visegrádi, esztergomi, budai és soproni megbízatásainak köszönhetően fiatal éveitől kezdve az ország leglátványosabb leletanyagait elemezhette, s a téma máig legjelentősebb hazai kutatójává vált.

Eredményeit annak köszönhette, hogy bár kutatásainak fókuszában elsősorban a leletek álltak, elemzéseit rendkívül nagy körültekintéssel, a tágabb összefüggések figyelembevételével végezte.

Hagyatéka betekintést enged Holl Imre munkamódszerébe, amelyhez hozzátartozott az ásatási kontextus alapos, lehetőség szerint helyszíni tanulmányozása, valamint a történeti források felgyűjtése és elemzése is, amelyekből szintén számos publikáció született. Az így nyert információkat az adott tárgyakhoz készített, rajzos vagy fotóval ellátott jegyzetekben foglalta össze.